Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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