Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ALX1Q15699 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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