Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCEA2Q15560 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms