Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYTH1Q15438 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYTH1Q15438 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms