Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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NCF4Q15080 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCF4Q15080 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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