Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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