Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NEUROD1Q13562 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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