Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MKRN4PQ13434 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC110015.1-201ENST00000423367 440 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 OR4A18P-201ENST00000529103 1088 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 NDE1P2-201ENST00000605569 1105 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MKRN4PQ13434 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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