Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PMS2P3Q13401 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PMS2P3Q13401 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PMS2P3Q13401 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PMS2P3Q13401 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PMS2P3Q13401 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PMS2P3Q13401 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PMS2P3Q13401 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PMS2P3Q13401 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PMS2P3Q13401 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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