Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF1Q13077 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF1Q13077 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms