Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK3Q13003 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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