Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HSPB3Q12988 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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