Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SREBF2Q12772 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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