Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UBE3AQ05086 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
UBE3AQ05086 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms