Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BACE1P56817 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BACE1P56817 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms