Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms