Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTPAP49638 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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