Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms