Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDC27P30260 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDC27P30260 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDC27P30260 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDC27P30260 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDC27P30260 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms