Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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PTPRBP23467 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
PTPRBP23467 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PTPRBP23467 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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