Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BGNP21810 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BGNP21810 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BGNP21810 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BGNP21810 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms