Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DCTN3O75935 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DCTN3O75935 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms