Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KIF1CO43896 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms