Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TTLL13PA6NNM8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms