Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL33A6NCF5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms