Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MTMR11A4FU01 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms