Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CACNA2D2Q9NY47 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms