Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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TDP1Q9NUW8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TDP1Q9NUW8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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