Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM7

PINK1, Serine/threonine-protein kinase PINK1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PINK1Q9BXM7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PINK1Q9BXM7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PINK1Q9BXM7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms