Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PI4K2AQ9BTU6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PI4K2AQ9BTU6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms