Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
C2orf48Q96LS8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms