Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD3Q96L08 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms