Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NSMCE1Q8WV22 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms