Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMIEQ8NEW7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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TMIEQ8NEW7 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMIEQ8NEW7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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