Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC141Q6ZP82 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms