Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TSSK4Q6SA08 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms