Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LACTB2Q53H82 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LACTB2Q53H82 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms