Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COL24A1Q17RW2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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