Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP6Q16828 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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