Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKAP5Q14008 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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