Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOFQ13790 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOFQ13790 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
APOFQ13790 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
APOFQ13790 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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APOFQ13790 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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APOFQ13790 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
APOFQ13790 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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