Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PEX6Q13608 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PEX6Q13608 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PEX6Q13608 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PEX6Q13608 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PEX6Q13608 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PEX6Q13608 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
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PEX6Q13608 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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