Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms