Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIN2AQ12879 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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