Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGEF5Q12774 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms