Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RAD23AP54725 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms