Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TAF6P49848 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TAF6P49848 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms