Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FDFT1P37268 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms