Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMPK1P30085 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMPK1P30085 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMPK1P30085 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms