Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNMT1P26358 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNMT1P26358 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms